“Hundred” -yaitu satu-satunya senjata yang bisa menentang bentuk kehidupan misterius “Savage” dari mengunjungi bumi.
Protagonis, Kisaragi Hayato, bertujuan untuk menjadi Ahli Seni Bela Diri menggunakan Hundred ini. Dia berhasil masuk ke kapal perang universitas Little Garden.

Namun-

“Aku ingin bertemu denganmu, Hayato !!!”
“Ba-Bagaimana kau tahu namaku?”

Diantara teman sekamar, Emil Crossford, yang entah bagaimana tahu dia baik (?), Hayato mendapat firasat tidak enak.
Terlebih lagi, setelah upacara masuk, ia diminta duel dengan ahli seni bela diri terkuat kampus “Queen” Claire Harvey …!?

Akademi pertempuran utama dimulai di sini!